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2017年9月11日 (月)
Ribeiro, P.J., Christensen, O.F., Diggle, P.J. (2003) geoR and geoRglm:
Software for Model-Based Geostatistics. Proceedings of the 3rd International Workshop on Distributed Statistical Computing (DSC 2003).
Rの空間統計パッケージ geoR と geoRglm の紹介。実戦投入前の儀式として読んだ。うっかりdraftのほうを読んじゃったんだけど、中身はだいたい同じだろう、と思うことにする。
えーっと、geodataというクラスを用意しています。簡単にプロットできるし、簡単に経験バリオグラムが描けます。
空間統計モデルとして、geoRではガウシアンモデル、ならびにbox-cox変換した従属変数についてのガウシアンモデルが組めます。geoRglmでは、box-cox変換した従属変数についてのポワソンモデル、ならびにロジットリンクの二項モデルが組めます。パラメトリックなバリオグラム・モデルを使います(デフォルトはMeternモデル)。推定量としてMLとREMLをご用意してます。いくつかのクリギング手法をご用意してます。あっ、そうそう、ベイジアン・クリギングもできますよ、自前でMCMCの機能を持っています。
云々、云々。
論文：データ解析(2015-) - 読了：Ribeiro, Christensen, Diggle (2003) Rの空間統計パッケージ geoR と geoRglm